Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2Q1Q7Z7E8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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