Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APTXQ7Z2E3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms