Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRP9Q7RTR0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms