Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q7L0L9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q7L0L9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q7L0L9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q7L0L9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q7L0L9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q7L0L9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms