Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms