Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2AFVQ71UI9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFVQ71UI9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms