Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP34Q70CQ2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP34Q70CQ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms