Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms