Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms