Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCBE1Q6UXH8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms