Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms