Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED9Q6R2W3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms