Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms