Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASC4Q6P4E1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASC4Q6P4E1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms