Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LETMD1Q6P1Q0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETMD1Q6P1Q0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms