Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R18Q6NYC8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R18Q6NYC8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms