Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGMBQ6NW40 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms