Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RALGAPA1Q6GYQ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RALGAPA1Q6GYQ0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms