Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SUMO4Q6EEV6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms