Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms