Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC102BQ68D86 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms