Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1DP3Q658K8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1DP3Q658K8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms