Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHEQ5VZ18 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms