Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIF1Q5UIP0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIF1Q5UIP0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms