Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
RSPH4AQ5TD94 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RSPH4AQ5TD94 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms