Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf220Q5T0J3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms