Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CELF3Q5SZQ8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF3Q5SZQ8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms