Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FRMPD1Q5SYB0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FRMPD1Q5SYB0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms