Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms