Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCID2Q5JVF3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms