Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGD3Q5JSP0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD3Q5JSP0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms