Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRB2Q5IJ48 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRB2Q5IJ48 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms