Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA8Q53HL2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA8Q53HL2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms