Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
KRTAP19-7Q3SYF9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms