Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP27-1Q3LI81 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms