Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF3Q3KNV8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms