Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DRB5Q30154 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms