Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM71Q2Q1W2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms