Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX7Q2KHR2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX7Q2KHR2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms