Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC142Q17RM4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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