Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PTPRNQ16849 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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