Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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