Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM1Q16610 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM1Q16610 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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