Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN1Q16512 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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