Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN9AQ15858 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN9AQ15858 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
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