Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USF2Q15853 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USF2Q15853 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USF2Q15853 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USF2Q15853 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USF2Q15853 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USF2Q15853 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USF2Q15853 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USF2Q15853 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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