Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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