Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KARSQ15046 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KARSQ15046 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KARSQ15046 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KARSQ15046 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KARSQ15046 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KARSQ15046 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KARSQ15046 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KARSQ15046 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KARSQ15046 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KARSQ15046 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KARSQ15046 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KARSQ15046 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KARSQ15046 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KARSQ15046 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KARSQ15046 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
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