Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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