Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GAPVD1Q14C86 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms